Hygienemonitoring ist besonders wichtig in Bereichen wie der Lebensmittelproduktion, dem Gesundheitswesen, der Pharmazie, der Kosmetikindustrie und in Reinräumen. Lebensmittelproduktionsstätten müssen sicherstellen, dass ihre Produkte frei von pathogenen Mikroorganismen sind. Krankenhäuser und Arztpraxen müssen die Ausbreitung von Infektionen verhindern. Pharmazeutische und kosmetische Betriebe müssen die Reinheit ihrer Produkte gewährleisten, um die Sicherheit der Endverbraucher zu sichern. Reinräume erfordern strikte Kontrolle, um die Reinheit der Luft und Oberflächen zu gewährleisten.